ايماناً من المركز الثقافي القبطي الأرثوذكسي بأهمية تقدير الإنجاز والإبداع والتميز و تنمية الإنسان لخدمة المجتمع و الوطن و تشجيعا على بذل المزيد من الجهد و العمل و العطاء، خصص المركز أربعة جوائز سنوية تحمل أسماء
1- جائزة المركز الثقافي القبطي الأرثوذكسي للحكمة والشفقة «جائزة البابا شنوده الثالث».
2- جائزة المركز الثقافي القبطي الأرثوذكسي للثقافة والعلوم الإنسانية «جائزة الدكتورة/ علا غبور».
3- جائزة المركز الثقافي القبطي الأرثوذكسي للإبداع العلمي «جائزة د. مكرم مهنى».
4- جائزة المركز الثقافي القبطي الأرثوذكسي الحق في الحياة «جائزة الأستاذ/ فريد حبيب».