افتُتحت مكتبة مارمرقس يوم 26 يناير عام 2010 بيد مثلث الرحمات قداسة البابا شنودة الثالث لتوفير مختلف أشكال مصادر المعرفة الدينية و العامة التقليدية منها والمتقدمة وتقديمها للجمهور والباحثين. وذلك إيمانًا من المركز الثقافى القبطى الأرثوذكسى بأهمية المكتبات العامة في حياة الأمم والشعوب، و دورها فى نشر الثقافة و الأدب والفنون. تحتوى المكتبة على مصادر مطبوعة وإليكترونية في شتى المجالات ومنها القسم الديني كعلم اللاهوت، الهندسة المعمارية، الأدب، التاريخ، الشعر، الثقافة….الخ، كما تحوي مجموعة من الكتب النادرة وأرشيف للوثائق القبطية. ويجري الإعداد لربطها إلكترونيا بمكتبات الأديرة والكنائس ومختلف المؤسسات الأكاديمية داخل مصر وخارجها. وقد قام قداسة البابا المعظم البابا الأنبا تواضروس الثاني فى 18/11/2014م بافتتاح المكتبة الالكترونية و قسم التعليم الإلكتروني.
تضم هذه المكتبة أقسام القراءة الداخلية والإستعارة التي تجعل التراث القبطي مادة بسيطة شيقة للطفل، بوسائلها العملية والمطورة ، و التى صممت خصصياً من أجل الطفل، كما أن هناك العديد من الأنشطة الدورية كتلاوة القصص، وورش العمل لتنمية المهارات الفنية اليدوية، من أجل نمو النواحي الاخلاقية والجمالية لشخصية الطفل من خلال التراث القبطي.
سعيًا من مكتبة مارمرقس العامة في تعزيز قدرات روادها، تقيم المكتبة جلسات مناقشة للكتب بجانب إقامة أنشطة قراءة كتب و صور لتطوير مواهب و قدرات الأطفال لتعزيز قدرات ومهارات الأفراد و تطويرها و نشر الثقافات المختلفة و ثقافة القراءة فى المجتمع. للمزيد