• يهدف المركز إلى الحفاظ على التراث القبطي الغني بتاريخه وثقافته ونشره حتى يتمكن العلماء والباحثين من الاستفادة منه في مصر وجميع أنحاء العالم من خلال اتاحة مصادر الأبحاث أمام الباحثين في كل فروع المعرفة القبطية مثل الفن القبطي والعمارة واللغة والأدب والتاريخ الكنسي وأقوال الآباء والدراسات المسكونية.
• حث الأجيال الجديدة على غرز الشعور بالهوية والوعي المرتكز على المعتقدات والثقافة القبطية.
• كشف قيمة الأديرة القديمة لتاريخ مصر والتقليد المسيحي في جميع أنحاء العالم، حيث أن الرهبنة المصرية هي أصل الرهبنة الغربية والشرقية.
• دعم الحركة المسكونية بما يتفق مع عراقة تقاليد وثقافة التاريخ القبطى.
• “من قلب الكنيسة القبطية إلى قلب مصر” كجسر للتفاهم بين الكنيسة والمجتمع المصري.
• تقديم الخدمات الإنسانية.
• التعريف بأهمية تراث مصر القبطي عبر التاريخ.
• منارة شاملة ومهمة للباحثين والمهتمين فى كل فروع المعرفة العامة والثقافات.
• نواة لانفتاح الكنيسة على الحضارات وإتاحة مصادر الأبحاث أمام الباحثين في كل فروع المعرفة.
• توضيح تاريخ الرهبنة المصرية و دورها في جميع أنحاء العالم.
• اكتشاف وتكوين وتنمية وبناء الكوادر البشرية.
• تقديم مختلف الخدمات التعليمية بما يتناسب مع أهداف المركز.
